张锋再造三合一第一组抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

近日，麻省理工学院和哈佛大学Broad比对所传来好消息：Pardis C. Sabeti、张锋等科学研究联合开发出新一种新型的抗生素接种子系统。21世纪上有许多类似于的致命病原体都是基于单链RNA的病毒接种，像是结核病病毒接种、屯卡病毒接种和亚型接种。该子系统在CRISPR Cas13新技术的基础上再次升级，可运用于检查和破坏本能肝细胞中所具有单链RNA的病毒接种。该比对公开发表在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR子系统为抗生素接种分析方法带来曙光在此之前，张锋小组的比对其他部门凭借着CRISPR/Cas9子系统为加固免疫子系统抵抗生素接种进犯带来新期望。然而，进犯本能的病毒接种十分多变，即使是在同一物种内，也能不断适应环境。因此我们需要颇为灵活的预防病毒接种平台。为了探寻新抗生素接种解决方案，比对其他部门将目光投向了CRISPR Cas13子系统，Cas13蛋白质可以天然地载体细菌中所的病毒接种RNA。它可以对蛋白质开展面向对象，从病毒接种颗粒中所消除特定的核糖核酸数列。尽管CRISPR Cas13子系统无论如何不存在一些在实践中所，但是该分析方法在科学研究室中所易于转换，并且在此之前张锋小组的比对其他部门在哺乳动物肝细胞中所不太似乎开展了充分的科学研究证明。比对其他部门开发了一种名叫CARVER的新型平台，它能将Cas13介导的病毒接种RNA裂解与基于Cas13的快速检验读数结合起来，采用特定的高灵敏度蛋白质简报分子解锁（SHERLOCK）平台，检查消灭基于RNA的病毒接种。创建；也的子系统比对其他部门首先筛选了350多个本能相关病毒接种（HAV）基因数列，以检验Cas13可以有效地载体的病毒接种RNA数列。他们主要寻找的是既不易凋亡，又最有似乎在切割后制剂病毒接种的短片。病毒接种基因数列中所潜在的Cas13目标启动子哈佛大学Cameron Sabeti科学研究室的英国剑桥大学Myhrvold博士透露：“理论上，你可以面向对象Cas13来攻击病毒接种的任何部份。但是物种之下和物种之间都有相当大的多样性，随着病毒接种的进化，部份基因数列都牵涉到了迅速的波动。如果你不分心，你似乎会信念最终没有效地果的目标。”然后，他们通过计算比对测序信息，以未确定数百种病毒接种物种中所的数千个潜在启动子，这些启动子似乎是Cas13的有效地靶标。再一，比对其他部门设计了该子系统的Cas13指导RNA。新面向对象的Cas13在接种了免疫肝细胞性脉络膜肺炎病毒接种（LCMV）、乙型肝炎亚型接种（IAV）和水泡性口炎病毒接种（VSV）的本能肝细胞中所开展了科学研究测试。将Cas13引入容器后24小时，比对其他部门通过观察到人才物中所病毒接种RNA的低水平降低了40倍。随后，比对其他部门检验了Cas1抑制病毒接种接种性的能力也。比对信息辨识：病毒接种渗透到后八小时，Cas13将亚型接种的接种力降低了300倍以上。就此，该小组采用SHERLOCK检查新技术来实时校准Cas13载体后的病毒接种RNA低水平。该检查子系统给予了有关化疗效用的快速反馈以及有关特定病毒接种凋亡的文档。章中对于病毒接种接种的化疗，虽然不太似乎准许了90多种抗生素接种药物，但它们只能化疗9种营养不良。总体而言，只有16种病毒接种具有FDA准许的疫苗。因此，找到行之有效地的抗生素接种分析方法过于尤为重要。该比对的第一编者 Catherine Freije 透露：“Cas13可以是一种比对工具，来探寻本能肝细胞中所病毒接种生物学的许多方面，它也似乎是一种临床工具，运用于检验采样，化疗病毒接种接种，并衡量化疗的有效地性——所有这些都能让CARVER在新或耐药性病毒接种出新现时迅速适应和应对。”