献给初学者:常用的细胞凋亡侦测方法

2022-01-24 01:53:47 来源:
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在实验室里面经常能够扫描受体的增生可能会,这里总结了几种常见的增生扫描方律,希望能够帮到你。

一受体增生的生物学扫描

遭遇增生的受体在基本上上有一定的相同之处。

光学电子显微镜和倒置电子显微镜

未精油受体:增生受体的锥半径增大、变形,受体薄膜比较简单但消失发泡情形,受体增生后期可见增生小锥体。贴壁受体消失皱缩、变圆、脱落。

精油受体:常用姬姆萨精油、瑞氏精油等。增生受体的氢糖油脂、排斥,氢薄膜甲醇、氢糖分立成块锥状和增生小锥体等众所周知的增生基本上。

萤光电子显微镜和共有展示单单等离子扫描电子显微镜

一般以受体氢氢糖的生物学彻底改变为指上标来上标新立异受体增生的进展可能会。

常用的 DNA 特异性精油有:HO 33342(Hoechst 33342),HO 33258(Hoechst 33258),DAPI。三种精油与 DNA 的联结都是非软件系统的,主要联结在 DNA 的 A-T 碱基区。紫外光驱使时人造卫星昏暗的蓝色萤光。

Hoechst 是与 DNA 特异联结的活性精油,贮存盐酸用蒸馏水除去 1 mg/ml 的酸度,采用时用 PBS 酒精,惟有酸度为 10 μg/ml。

DAPI 为半通透性,可用原则上相同受体的精油。贮存盐酸用蒸馏水除去 1 mg/ml 的酸度,采用惟有酸度一般为 10 μg/ml。

结果上标新立异

受体增生全过程里面受体氢氢糖的生物学彻底改变分为三期:Ⅰ 期的受体氢深褐色波纹锥状(rippled)或深褐色折缝样(creased),其余部分氢糖消失油脂锥完全;Ⅱa 期受体氢的氢糖很高度包容、排斥;Ⅱb 期的受体氢甲醇为劈开,激发增生小锥体(上图 1)。

透射电子电子显微镜注意到

结果上标新立异

增生受体锥半径增大,受体质油脂。增生Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的受体氢内氢糖很高度盘绕,消失许多称为气穴情形(citations)的空泡结构;Ⅱa 期受体氢的氢糖很高度包容、排斥;受体增生的后期,受体氢甲醇为劈开,激发增生小锥体(上图 2)。

二Annexin V 律

基质甲基酪氨酸(Phosphatidylserine, PS)短时间坐落受体薄膜的后侧,但在受体增生的以前,PS 可从受体薄膜的后侧翻转到受体薄膜的微小,暴露在受体外环境里面(上图 3)。Annexin-V 是一种小分子为 35~36 KD 的 Ca2+ 依赖性基质联结受体,能与 PS 很高亲和力特异性联结。将 Annexin-V 来进行萤光素(FITC、PE)或 biotin 上上标,以上上标了的 Annexin-V 作为萤光探头,为了让流式受体星象或萤光电子显微镜可扫描受体增生的遭遇。

很高氯酸丙啶(propidine iodide, PI)是一种氢酸精油,它只能透过比较简单的受体薄膜,但在增生里面后期的受体和死受体,PI 能够透过受体薄膜而使受体氢红染。因此将 Annexin-V 与 PI 意味着采用,就可以将增生较早后期的受体以及死受体区分开来。

方律

凝胶受体的精油:将短时间养成和可借增生的凝胶受体(0.5~1×106)用 PBS 洗净 2 次,重新另加入 100 μl Binding Buffer 和 FITC 上上标的 Annexin-V(20 μg/ml)10 μl,固体避光 30 min,再重新另加入 PI(50 μg/ml)5 μl,避光反应物 5 min 后,重新另加入 400 μl Binding Buffer,立即用 FACScan 来进行流式受体术系统性扫描(一般不至少 1 h), 同时以不另加 AnnexinV-FITC 及 PI 的一管作为形容词折衷。

贴壁养成的受体精油:先行用 0.25% 的胰复合物新陈代谢,洗净涤、精油和量既有同凝胶受体。

爬单单片受体精油:同上,之前用萤光电子显微镜和共有展示单单等离子扫描电子显微镜来进行注意到。

结果

要点

1. 整个另加载跳跃要尽量轻柔,不应手脚吹打受体。

2. 另加载时注意避光,反应物天内后尽快在一小时内扫描。

三线粒锥体薄膜作用力的扫描

线粒锥体在受体增生的全过程里面起着交汇点功用,多种受体增生冲动因子可借可借相同的受体遭遇增生,而线粒锥体跨越薄膜电位(Δψm)的下降,被认为是受体增生适配反应物全过程里面可追溯遭遇的意外事件,它遭遇在受体氢增生相同之处(氢糖油脂、DNA 撕裂)消失之前,一旦线粒锥体跨越薄膜电位停滞,则受体增生不可逆转。

线粒锥体跨越薄膜电位的存在,使一些亲脂性阳离子萤光精油如 Rhodamine 123、3,3-Dihexyloxacarbocyanine iodide(DiOC6)、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide(JC-1)、Tetramethyl rhodamine methyl ester(TMRM)等可联结到线粒锥体基质,其萤光的增强或减弱解释线粒锥体内薄膜电负性的升很高或减缓。

方律

将短时间养成的受体和可借增生的受体重新另加入采用惟有酸度为 Rhodamine 123(1 mM)或惟有酸度为 DiOC6(25 nM),JC-1(1 mM),TMRM(100 nM),37 °C 均衡 30 min,流式受体不下扫描受体的萤光风力。

要点

1. 始惟有保持均衡染盐酸里面 pH 最大值的正确性,因为 pH 最大值的推移将严重影响薄膜电位。

2. 与精油达致均衡的受体悬盐酸里面如果成份受体,他们将与其余部分精油联结,减缓精油的酸度,引起假去极既有。

四DNA 比较简单版既有扫描

受体增生时主要的生既有相同之处是其氢糖遭遇油脂,氢糖 DNA 在氢小锥体该单位之间的连接处撕裂,转变成 50~300 kbp 粗大的 DNA 大比较简单版,或 180~200 bp 整数倍的寡氢苷酸比较简单版,在胶状电泳上观感为梯形电泳上图谱(DNA ladder)。

受体经处理方式后,采用原则上方律受控提纯 DNA,来进行琼脂糖胶状电泳和溴既有乙啶精油,在增生受体群里面可注意到到众所周知的 DNA ladder。如果受体量来得为少,还可在受控提纯 DNA 后,用 32P-ATP 和脱氧氢糖氢苷酸末端转移复合物(TdT)上上标 DNA,然后来进行电泳和点状自显影,注意到增生受体里面 DNA ladder 的转变成。

大分子线粒锥体 DNA 比较简单版的系统性

受体增生的以前,线粒锥体撕裂成为 50~300 kbp 粗大的 DNA 大比较简单版。所有至少一定小分子形状的双链 DNA 分子在琼脂糖胶状里面的迁移速度相同。频域 DNA 的双螺旋半径至少胶状半径时,即达致分辨力的连续性。此时胶状便按小分子的形状来筛分 DNA,DNA 像通过特罗斯季亚涅齐一样,以其两端看做电磁场一极而通过胶状,这种迁移模式称之为「爬单单行」。因此,受体增生以前激发的 50~300 kbp 粗大的 DNA 大比较简单版只能用普通的琼脂糖胶状电泳来受控。

通常采用脉冲电泳新科技可圆满地彻底解决这一问题。这个方律是在胶状上外另加内积的交变脉冲电磁场。每当电磁场斜向彻底改变后,大的 DNA 分子便停留在爬单单行管里面,直至属于自己电磁场接触点再定向后,才能继续向右加速移动。DNA 小分子变大,这种自由基所能够的一段时间就越粗大。当 DNA 分子叠另加斜向的一段时间小于射频周期时,DNA 就可以按其小分子形状分开。

DNA Ladder 系统性

方律

获得好评受体(1×107)硫酸→受体甲醇盐酸→13 000 rpm ×5 min→搜罗上乾隆年间,另加 1% SDS 和 RnaseA(5 mg/ml)56 °C,幼锥体 2 h→赖氨酸 K(2.5 mg/ml)37 °C,2 h→1/10 锥半径 3 mol/l 醋酸钠和 2.5 倍锥半径的冷热无水乙醇硫酸 DNA,4 °C 清早→14 000 rpm×15 min→之前将硫酸溶解在 TE buffer 里面,另加 DNA Loading Buffer→1.2% 琼脂糖胶状电泳,EB 精油并光学星象器。

结果

增生受体 DNA 含量的流式受体不下量既有

方律

搜罗受体→70% 冷热乙醇(PBS 酒精)4 °C 相同清早→PBS 洗净涤,1 000 rpm × 10 min→RNase A(0.5 mg/ml)37 °C 新陈代谢 30 min→PI(50 mg/ml)精油,固体避光 15 min→FACScan 量既有 DNA 亚二倍锥体的转变成及受体周期的推移。

结果

ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay

实用性:敏感度很高,适合于扫描少量样品,小其余部分增生受体。如医学活其组织扫描。

五TUNEL 律

受体增生里面,线粒锥体 DNA 双链撕裂或单链撕裂而激发大量的胶状 3'-OH 末端,可在脱氧氢糖氢苷酸末端转移复合物(TdT)的功用下,将脱氧氢糖氢苷酸和萤光素、过氧既有物复合物、盐类磷酸复合物或生物素转变成的类似物上上标到 DNA 的 3'-末端,从而可来进行增生受体的扫描,这类方律称为脱氧氢糖氢苷酸末端转移复合物内皮细锥体的缺口末端上上标律(terminal -deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling, TUNEL)。

由于短时间的或正在增殖的受体几乎没有 DNA 的撕裂,因而没有 3'-OH 转变成,来得为少能够被精油。TUNEL 实际上是分子生物学与生物学相联结的量既有方律,对比较简单的单个增生受体氢或增生小锥体来进行特罗斯季亚涅齐精油,能准确地反应物受体增生众所周知的生物既有学和基本上相同之处,可可用石蜡包埋其组织薄片、冰冻其组织薄片、养成的受体和从其组织里面受控的受体的受体基本上系统性,并可扫描单单极少量的增生受体,因而在受体增生的量既有里面被广泛采用。

六Caspase-3 活性的扫描

Caspase 后代在内皮细锥体受体增生的全过程里面起着来得为重要的功用,其里面 Caspase-3 为关键的指派分子,它在增生信号传递的许多途径里面展现功能。Caspase-3 短时间以复合物原(32 KD)的形式存在于真核细锥体里面,在增生的以前过渡期,它被激活,增殖的 Caspase-3 由两个大亚基(17 KD)和两个小亚基(12 KD)组成,甲醇其所的真核细锥体锥体氢反应物,最惟有导致受体增生。但在受体增生的后期和死亡受体,Caspase-3 的活性明显下降。

Western blot

量既有 Procaspase-3 的增殖,以及增殖的 Caspase-3 及对反应物多聚(ADP-氢糖)受体复合物(PARP)等的甲醇。

方律

搜罗受体→PBS 洗净涤→抽提受体甲醇盐酸→受体系统性→SDS-PAGE 电泳→纤维素薄膜或 PVDF 薄膜转移→5% 脱脂封闭,固体 1.5~2 h 或 4 °C 清早→Caspase-3 多抗或单抗固体反应物 1~2 h 或 4 °C 清早→TBS-T(含 0.05% Tween 20 的 TBS)洗净 3 次,5~10 min/次→HRP-上上标的驴抗鼠 IgG 或 AP 上上标的驴抗鼠 IgG 固体反应物 1~2 h→ TBS-T 洗净 3 次, 5~10 min/次→ECL 显影或 NBT/BCIP 金属氧既有物。

结果

萤光光度不下光度不下量既有

增殖的 Caspase-3 能够特异切割 D1E2V3D4-X 反应物,水解 D4-X 肽键。根据这一特点,建筑设不下单单萤光物质偶联的来得长肽 Ac-DEVD-AMC。在共有价偶联时,AMC 只能被驱使萤光,来得长肽被水解后释放单单 AMC,自由的 AMC 才能被驱使人造卫星萤光。根据释放的 AMC 萤光风力的形状,可以系统性 Caspase-3 的活性,从而反映 Caspase-3 被增殖的总体。

方律

获得好评受体短时间或增生受体→PBS 洗净涤→催既有受体甲醇盐酸→另加 Ac-DEVD-AMC(caspase-3 萤光反应物)→37 °C 反应物 1 h→萤光光度不下光度不下(Polarstar)量既有萤光风力(驱使光波粗大 380 nm,人造卫星光波粗大为 430~460 nm)。

结果

流式受体术量既有

方律

获得好评受体短时间或增生受体→PBS 洗净涤→另加 Ac-DEVD-AMC→37 °C 反应物 1 h→UV 流式受体不下量既有 Caspase-3 阳性受体数和平均萤光风力。

结果

七TFAR19 受体表达单单来和受体导向量既有

TFAR19(PDCD5)是由本量既有室在欧美国家首先行报导的一个享有自己著作权的人类新基因,中后期的功能量既有确实,它是促进受体增生的增强剂。为了让萤光素(FITC)上上标的 TFAR19 酵母菌为探头,对受体增生全过程里面 TFAR19 受体的表达单单来很高度及导向量既有辨认单单,增生以前 TFAR19 表达单单来很高度升很高并消失加速氢举例来说情形,伴随着受体氢生物学的推移,持续较粗大一段时间,在增生小锥体里面基本上可见。

同时我们辨认单单,增生以前 TFAR19 受体的氢举例来说较早于基质甲基酪氨酸(PS)外翻和受体氢 DNA 的比较简单版既有,提示 TFAR19 受体的氢举例来说是受体增生来得以前遭遇的意外事件之一。全面性的量既有假定,增生以前 TFAR19 的氢举例来说具备普遍意义,相同受体增生以前均消失 TFAR19 很高表达单单来和氢举例来说。这为量既有受体增生以前所遭遇的意外事件,提供了一种属于自己新科技和指上标。

TFAR19 受体的受体导向量既有

涂层氢既有

FITC 上上标的酵母菌,pH 7.4 、0.15 mol/L PBS,3% 的多聚甲醛,PBS-T(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 含 0.2% Tween 20),胎牛血盐酸,萤光受体洗净盐酸(pH 7.4 、0.15 mol/L PBS 含 2% 胎牛血盐酸及 0.1% NaN3),FACS 管,Tip 头,移盐酸器。

星象器

汽既有很高度铍,37 °C 水浴箱,萤光电子显微镜,共有展示单单等离子扫描电子显微镜,流式受体星象。

方律

1. 凝胶受体的精油

(1)获得好评短时间和可借增生的受体(0.5~1×106),PBS 洗净 2 次,1 000 rpm×10 min。

(2)3% 多聚甲醛冰浴 10 min,PBS 洗净 2 次,1 000 rpm×10 min。

(3)重新另加入 PBS-T 溶盐酸,37 °C 幼锥体 15 min,PBS 洗净 2 次,1 000 rpm×10 min。

(4)重新另加入 200 ml 胎牛血盐酸,固体反应物 30 min。

(5)重新另加入 5 ml FITC 上上标的 TFAR19 单抗(惟有酸度为 1:40),4 °C 反应物 30 min。

(6)萤光受体洗净盐酸洗净 2 次,1 000 rpm×10 min。

将受体硫酸滴片,萤光电子显微镜及共有展示单单等离子电子显微镜下注意到 TFAR19 在受体里面的导向。同时用流式受体星象系统性扫描 TFAR19 受体的平均萤光风力。

2. 贴壁受体的特罗斯季亚涅齐精油

(1)贴壁生粗大的对数期受体铺在 24 孔或 6 孔板里面(内有洁净盖玻片),让其爬单单片生粗大,待粗大到 50%~80 % 满时,增生可借剂处理方式受体。

(2)将相同一段时间点处理方式的受体来进行免疫萤光精油,精油步骤同上。

(3)将精油的爬单单片受体放于一张滴有少量(5 ml)的载玻片上,萤光电子显微镜或共有展示单单等离子扫描电子显微镜注意到 TFAR19 在受体里面的导向。

3. 医学病理薄片的精油、扫描

4. 原代受体的养成、扫描

5. 量既有 TFAR19 受体在人锥体内各其组织器官的产自及导向

TFAR19 受体的表达单单来与医学癌症

ELISA 律扫描短时间人和癌症锥完全下,以及癌症的相同初,血盐酸里面 TFAR19 受体很高度及其 TFAR19 自身抗锥体很高度。

涂层和氢既有

1. 一般来讲 Buffer:pH 9.6, 0.05 mol/L 碳酸盐 Buffer

2. 洗净涤盐酸: pH 7.4,0.15 mol/L PBS 含 0.05% Tween 20

3. 封闭盐酸: 3% BSA(用洗净涤盐酸配制)

4. 复合物上标抗锥体的酒精:用封闭盐酸酒精

5. OPD 反应物 Buffer:Na2 HPO4·12 H2O 1.84 g,柠檬酸 0.51 g,DDW 100 ml

6. 金属氧既有物盐酸(现配现用):反应物 Buffer 10 ml,OPD 2 mg,30% H2O2 2 ml

7. 惟有止盐酸 2 mol/L H2SO4

8. 重新组建人 TFAR19,HRP 上上标的驴抗人 IgG9 ELISA 板,Tip,移盐酸器,ELISA Reader(OD 490 nm),洗净板机

另加载步骤

1. 用一般来讲 Buffer 酒精的重新组建人 TFAR19(1 mg/ml)一般来讲 ELISA 板,100 ml/well,37 °C 幼锥体 2 h 或 4 °C 清早(一般 24 h 以上)。

2. 洗净涤 Buffer 洗净板三次,重新另加入封闭盐酸,200 ml/well , 37 °C 幼锥体 2 h 或 4 °C 清早。

3. 洗净涤 Buffer 洗净板三次,重新另加入相同酒精度的病人血盐酸(3 个以此类推孔)100 ml/well ,37 °C 幼锥体 1 h。设一般来讲 Buffer、洗净涤 Buffer 、封闭盐酸为形容词折衷。

4. 洗净涤 Buffer 洗净板三次,重新另加入 1:2 500 酒精的 HRP 上上标的抗人 IgG, 100 ml/well,37 °C 幼锥体 1 h。

5. 洗净涤 Buffer 洗净板三次,重新另加入金属氧既有物盐酸,100 ml/well,避光反应物 10~15 min。

6. 重新另加入 H2SO4 惟有止反应物,50 ml/well。

7. ELISA Reader 读取 OD 490 光密度最大值,量既有和相当病人血盐酸和短时间血 乾隆年间里面 TFAR19 自身抗锥体的表达单单来很高度。

8. Western blot 量既有原发性受体和短时间受体的 TFAR 19 受体的表达单单来很高度。

的有

Brown,D.G., Sun, X.M., and Cohen, G.M.(1993) Dexamethasone-induced apoptosis involves cleage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J. Biol.Chem. 268, 3037-3039

Herrmannm M, Lorenz HM, Voll R et al. A Rapid and simple method for the isolation of apoptotic DNA fragments. Nucleic Acid Res. 1994; 22:5506-5507

文中是从:丁香园站友 midas

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编辑: 任悠悠

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